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那些年,我們一起追過的WB實驗

時間:2015/7/6閱讀:4020
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那些年,我們一起追過的WB實驗,總是因為環(huán)節(jié)多、耗時長讓實驗室的達(dá)人們頭疼不已。雖然天天做Western blot,但不是忙上一天zui后看不清條帶,就是條帶清晰了樣品間差異很難重復(fù)。今天就讓我們來看看如何追到WB實驗這位高冷范兒的沈佳宜。


Westernblot的困惑

  • Westernblot環(huán)節(jié)多、耗時長,即便是同一樣品跑同一塊膠,zui終條帶間灰度差異也高達(dá)10%。雖然天天做Western blot,但不是忙上一天zui后看不清條帶,就是條帶清晰了樣品間差異很難重復(fù)。
  • 不知道曝光多久?不知道顯影多久合適?定量結(jié)果不確定?結(jié)果無法重現(xiàn)?


哥家AWB真身


    GE的Amersham WB system (AWB)集成了的Western blot實驗流程,從電泳、轉(zhuǎn)印、印跡到zui終成像分析功能,讓以往手工作坊式的WB自動化、快速化和標(biāo)準(zhǔn)化,大大減少實驗中的差異,帶來一致的、定量的蛋白質(zhì)分析結(jié)果。這臺*一體化的系統(tǒng)由哥家位于瑞典烏普薩拉的蛋白科學(xué)中心實驗室研發(fā),于2014年底上市后便已助力了CancerCell文獻(xiàn)。

    AWB由主機(jī)、軟件和專屬耗材組成。主機(jī)包括兩部分:電泳與成像單元和印跡與孵育單元。

    AWB系統(tǒng)可以保證Westernblot實驗在4小時之內(nèi)完成,而無需一整天的漫長等待。


AWB重新定義實驗步驟

    *步:電泳 

    在這一步中,我們使用恒定溫度、高度均一的電流裝置,配合質(zhì)量穩(wěn)定的高分辨率預(yù)制膠和無液體的緩沖液條,將時間由2小時節(jié)省到42分鐘,也讓電泳步驟的波動降到zui低。電泳一旦到達(dá)檢測前沿,電泳自動停止并成像評估。


    第二步:轉(zhuǎn)印 

    從制作三明治,到蛋白質(zhì)從凝膠轉(zhuǎn)移到膜上,所有關(guān)鍵的參數(shù)和組件都經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)化,有利于帶來*的結(jié)果和zui低的背景。AWB PVDF卡設(shè)計巧妙,可避免用戶誤操作,而濾紙也已經(jīng)切好,配合轉(zhuǎn)印架的設(shè)計,減少出錯的可能。在關(guān)閉轉(zhuǎn)印架時,內(nèi)置的滾筒可以去除氣泡,增加重現(xiàn)性。內(nèi)置的冷卻也能保持恒定的溫度,避免過熱。


    第三步:孵育 

    大家都知道,抗體孵育這一步是多么的瑣碎和煩心,守在小搖床邊等待與換液,消耗了大量的時間。AWB可以做我們的換液機(jī)器人,設(shè)置好程序即可放心走開,而孵育的程序總是可控,不用擔(dān)心人工情況下這次孵育時間長了信號強(qiáng)那次洗滌液加少了背景高。  


    第4步:檢測和成像 

    低熒光背景的PVDF卡,經(jīng)過優(yōu)化的熒光標(biāo)記試劑,以及高性能的激光掃描儀,這些帶來了高質(zhì)量的定量數(shù)據(jù)。因此,我們可以靈敏檢測蛋白豐度的微小變化,分離和比較磷酸化與非磷酸化蛋白,并在同一塊印跡上準(zhǔn)確測定高豐度和低豐度蛋白。


    第5步:分析

    對于數(shù)據(jù)分析而言,軟件的方便好用至關(guān)重要。掃描一結(jié)束,AWB軟件自動開展數(shù)據(jù)分析,通過柱狀圖、泳道圖和表格顯示關(guān)鍵信息。它能顯示所選擇泳道和條帶檢測結(jié)果,定量目標(biāo)蛋白相對雜質(zhì)的百分比,并利用總蛋白或內(nèi)參蛋白來歸一化目標(biāo)蛋白的信號,滿足科學(xué)界對WB結(jié)果越來越重視的定量化要求。


AWB的*之處

    標(biāo)準(zhǔn)化

    預(yù)制膠的使用避免了的凝膠質(zhì)量的不穩(wěn)定,實驗的參數(shù)化和程序化避免了人為因素的不穩(wěn)定,以總蛋白作內(nèi)參結(jié)合熒光技術(shù)避免了結(jié)果分析的不穩(wěn)定。


    快速化

    我們僅花了4小時便完成了WB實驗,提高了實驗室的工作效率和競爭力。


    自動化

    我們只需要做少量的準(zhǔn)備工作便可做甩手掌柜,讓手機(jī)上的Watch app來提醒。


從此,我們不再擔(dān)心Westernblot的結(jié)果像*了。通過這臺智能的儀器、專屬的耗材和精心優(yōu)化的實驗方案,可以獲得更加定量、更容易重現(xiàn)的Westernblot數(shù)據(jù)。這樣,就能少一些重復(fù),少一些優(yōu)化,也少一些troubleshooting。幫助實驗達(dá)人們追到WB實驗這位高冷范兒的沈佳宜。

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