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轉(zhuǎn)移性癌癥患者有望從液體活檢中受益
點擊次數(shù)：262 發(fā)布時間：2017-11-17
通過檢測血液中的游離DNA（cfDNA），究竟能否提供癌癥的線索，這個問題困擾了人們很久。近日，Broad研究所的研究人員在《Nature Communications》上發(fā)表文章稱，90%的腫瘤遺傳特征可通過血液樣本的全外顯子組測序檢測到，這種方法可應(yīng)用在近半的晚期癌癥患者身上。 通訊作者之一、Broad研究所的Viktor Adalsteinsson博士表示：“我們的zui終目標(biāo)是利用血液活檢來全面搜索和鑒定哪怕是zui小的腫瘤殘留。隨著腫瘤進展到晚期，形成耐藥性或成為轉(zhuǎn)移瘤，我們希望在關(guān)鍵的時間點介入，決定哪種療法患者。”
對癌癥患者而言，侵入性的手術(shù)活檢是痛苦且困難的，而且有些腫瘤的位置很難觸及。如今，液體活檢正成為一種新興的替代方法。通過檢測和分析患者血液樣本中的癌癥DNA，它有望克服傳統(tǒng)活檢的問題，讓醫(yī)生可實時追蹤疾病進展和治療情況，并幫助研究人員了解腫瘤的耐藥性如何形成。
收集DNA片段的全外顯子組，需要血液樣本中至少有10%的腫瘤DNA，但這個比例因患者而異?；诖耍芯咳藛T首先需要一種無偏倚的方法來測定癌癥DNA的水平，然后再開展測序。目前的許多血液活檢方法是篩查已知的癌癥相關(guān)基因，但這種靶向重測序方法可能會漏掉一些癌癥。
在這項研究中，研究人員開發(fā)出一種稱為ichorCNA的工具，它能夠分析癌癥基因組中普遍存在的各種突變模式，捕獲帶有已知和未知突變的癌癥。此外，他們重點檢測了癌細胞中拷貝數(shù)過高或過低的DNA片段。總共有1439個血液樣本被檢測，它們來自520名轉(zhuǎn)移性乳腺癌或前列腺癌患者。 利用這種方法，研究人員發(fā)現(xiàn)在33%到49%的轉(zhuǎn)移性癌癥患者中，腫瘤DNA的含量超過了游離DNA的10%。這意味著游離DNA的全外顯子組測序是可行的。“我們的研究已經(jīng)證明，我們能夠從血液中可靠地獲得癌癥外顯子組。它與腫瘤活檢相匹配，對相當(dāng)一部分轉(zhuǎn)移性癌癥患者有用，”Adalsteinsson博士指出。 之后，研究人員對41名患者開展進一步分析，將腫瘤活檢結(jié)果與游離DNA的外顯子測序數(shù)據(jù)相比較。他們發(fā)現(xiàn)，外顯子組測序和組織活檢的遺傳數(shù)據(jù)在很大程度上匹配，比如體細胞突變的匹配度達88%，拷貝數(shù)改變的匹配度達80%。這些結(jié)果表明，游離DNA的全外顯子組測序有望替代許多患者的轉(zhuǎn)移性腫瘤活檢。
總的來說，這項新的研究改進了血液活檢的分析流程，使其能夠在更大范圍內(nèi)開展。研究人員正在積極地將這項成果應(yīng)用在數(shù)千名轉(zhuǎn)移性癌癥患者上。“這項技術(shù)讓我們能夠追蹤癌癥的動態(tài)變化，了解耐藥性的演化以及轉(zhuǎn)移性狀態(tài)的發(fā)展，這是手術(shù)活檢無法實現(xiàn)的，”Broad研究所的Gad Getz談道。