物理方法占地面積大，基建費、運行費高，能耗大，管理復雜，易出現污泥膨脹現象; 設備不能滿足高效低耗的要求，單獨使用效果不明 顯?；瘜W方法運行成本高，消耗大量的化學試劑，易產生二次污染。多數情況下兩者須結合使用。
弊端一：當地拉不到活性污泥作為生化處理的基地，無法培養(yǎng)細菌。
弊端二：投加污泥耗時耗力
弊端三：微生物菌種少，見效達標速度慢。
弊端四：檢查不達標，達不到排放標準，費時費力。
弊端五：污泥培養(yǎng)的細菌不穩(wěn)定，容易導致菌落死亡。
弊端六：污泥容易膨脹發(fā)黑，容易造成二次污染。
從而改善這一現象就出現了生物針對性菌落
從經濟方面來說，微生物菌種處理廢水的成本低；從環(huán)境污染方面說，無二次污染，對環(huán)境影響??；從處理效果方面說，不僅可以去除有機物、病原體、
有害物質，還能去除臭味、提高透明度、降低色度等，處理效果好。
那么，接下來我們分別從經濟方面、環(huán)境污染、處理效果三個方面來詳細說明微生物菌種處理廢水的優(yōu)勢。
經濟方面：微生物菌種處理廢水經濟消耗包括微生物菌種、微生物菌種生長所需的營養(yǎng)源（碳源、氮源、磷源）和調節(jié)廢水PH所需的藥劑；為微生物
提供氧氣來源的曝氣裝置；污水污泥回流裝置，污泥處置裝置等。微生物具有很好的吸附性和沉降性，很強的降解能力，不需要高溫、高壓等苛刻的要求，
相比物理化學方法處理廢水的設備和長期投加的藥劑比較，處理費相對較低。所以現在的廢水處理都是以物理化學方法去提高廢水的生化性，再用生物方法
處理廢水的方式配合使用。
環(huán)境污染方面：微生物處理廢水是將廢水中的污染物最終轉化成二氧化碳、氮氣、水和污泥。二氧化氮、氮氣和水都是無毒無害的，污泥也能夠通過污
泥消解轉化成有機肥料，污泥也可以制作建筑材料。充分的表明了微生物處理廢水無二次污染物產生，不會對環(huán)境造成污染。
處理效果：微生物處理廢水，將廢水中的有機物降解轉化成二氧化碳、氮氣、水和污泥本身以去除有機物；微生物處理廢水，將廢水中的病原體吸附和
吞噬等方式以去除病原體；微生物處理廢水，將廢水中的有害物質氧化轉化成無毒位置或吸附到污泥上的方式以去除有害物質；微生物處理廢水，通過吸附、
降解和沉降提高水質的透明度和降低色度。篩選出合適的微生物菌種可將廢水中大多數污染物都降解。
現在生化處理廢水的微生物都是使用活性污泥，活性污泥對于不同的污水進行自馴化以適應該污水環(huán)境來處理污水。微生物菌種處理廢水，可檢測廢水
中的污染物類型，篩選出合適的菌種，通過共生的方式進行污水處理。針對性比較強，相應的處理效果較好
