1.溫度
種子在種子發(fā)芽箱內(nèi)，吸足水分后，還需在一定溫度條件下才能發(fā)芽。這是因為種子萌發(fā)過程中的生理生化變化還要有酶的活動。酶的催化作用，要有一定溫度，在一定范圍內(nèi)，溫度高，酶的催化作用強，種子內(nèi)藏物質(zhì)分解快，發(fā)芽的速度快，發(fā)芽率也高。
一般種子發(fā)芽zui低溫為10℃（粳稻）~12℃（秈稻）；zui適溫度為28℃~30℃；zui高為40℃~45℃。因此，春季過早播種（溫度低于10℃），稻種不僅不能發(fā)芽，還會因呼吸仍在進行而消耗營養(yǎng)物質(zhì)導(dǎo)致爛種。
即使發(fā)芽，低溫也會影響根系生長，易遭受土壤中有害微生物的侵襲，導(dǎo)致爛秧。在催芽過程中，如谷堆溫度過高（高于40℃），會引起燒芽，谷粒失去生活力而造成損失。
2.氧氣
種子萌發(fā)分為兩個性質(zhì)不同的階段，第1階段從種子吸漲到破胸，這時在有氧或無氧的條件下，均以無氧呼吸（發(fā)酵作用）為主，僅胚芽萌動，而幼根未伸長，芽鞘生長所需的少量能量由發(fā)酵作用供給就能維持。
第2階段是破胸后，氧氣可自由進入種子內(nèi)部，各種氧化酶的活動增強，以有氧呼吸為主，產(chǎn)生較多的能量和中間產(chǎn)物（酮酸），來滿足種子根、不*葉及*葉幼葉的生長需要。如果在缺氧條件下，進行無氧呼吸產(chǎn)生的中間物質(zhì)少，細胞結(jié)構(gòu)物質(zhì)的原料供應(yīng)少，而能量也僅為有氧呼吸的l／28左右。分解產(chǎn)物中的酒精還會對細胞產(chǎn)生毒害作用。因此，長時間的無氧呼吸對種子萌發(fā)和幼苗生長是不利的。
